マサラタウン         ・オーキド博士からポケモンをもらう

                ・ライバルとバトルする。

                     ↓

トキワシティ        ・フレンドリィショップで「お届け物」を預かる。

                       ↓

マサラタウン      ・ポケモン図鑑を入手する。

             ・タウンマップを入手する。

                    ↓

ニビシティ      ・ニビジムでタケシに勝利。

                  ↓

                3番道路

                 ↓

お月見山        ・化石入手

             ・2人組のロケット団員とバトル。(ピカチュウ)

                    ↓

                 4番道路

                   ↓

ハナダシティ   ・ハナダジムでカスミに勝利

          ・ライバルとバトル

24番道路    橋の上で6人のトレーナーとバトル

               ↓

25番道路    ・みさきの小屋で「ふねのチケット」入手

                ↓

              5番道路

                ↓

              6番道路

                ↓

クチバシティ    ・桟橋からサントアンヌ号に乗る

                ↓

サントアンヌ号   ・2F通路でライバルとバトル

           ・船長さんから「秘伝マシン01」入手

               ↓

クチバシティ    ・クチバジムでマチスに勝利

              ↓

11番道路   ・ディグダの穴を抜けて2番道路へ

            ↓

2番道路    ・ゲートで「秘伝マシン05」を入手

               ↓

ハナダシティ   ・東の9番道路へ

             ↓

           10番道路

              ↓

シオンタウン    ・ポケモンタワーの情報収集

              ↓

            8番道路

             ↓

           7番道路

            ↓

タマムシシティ   ・タマムシデパート屋上で飲み物を入手して、7番道路のゲートの警備員に渡す

           ・イーブイ(L25)入手

          ・タマムシジムでエリカに勝利

         ・ゲームコーナーのロケット団アジトへ行く

                 ↓

ロケット団アジト   ・2人組のロケット団員とバトル(ピカチュウ)

            ・サカキを倒してシルフスコープを入手する

                ↓

シオンタウン     ・ポケモンタワーへ行く

                  ↓

ポケモンタワー  ・2Fでライバルとバトル

           ・2人組のロケット団員とバトル

           ・フジ老人から「ポケモンの笛」を入手する

                  ↓

16〜18番道路  ・カビゴンを起こす

           ・トレーナーとバトル

               ↓

セキチクシティ  ・セキチクジムでキョウに勝利

          ・サファリゾーンへ行く

             ↓

サファリゾーン  エリア3で「きんのいれば」、「秘伝マシン03」を入手する

                 ↓

セキチクシティ   ・園長さんに「きんのいれば」を渡し、「秘伝マシン04」を入手

                    ↓

12〜15番道路   ・カビゴンを起こす

             トレーナー達とバトル

                ↓

ヤマブキシティ  ・シルフカンパニーへ行く

              ↓

シルフカンパニー   ・7Fでライバルとバトル

             ・2人組のロケット団員とバトル(ピカチュウ)

            ・サカキを倒して、「マスターボール」を入手する

                   ↓ ヤマブキシティ  ・ヤマブキジムでナツメに勝利

             19・20番水道

                ↓

           ふたご島の洞くつ

              ↓

            20番水道

             

グレンタウン   ・ポケモン屋敷へ行く

            ↓

ポケモン屋敷 ・B1Fで「ひみつのカギ」を入手

           ↓

グレンタウン   ・グレンジムでカツラに勝利

             ↓

          21番水道

            ↓

トキワシティ   トキワジムでサカキに勝利

            ↓

22番道路  ・ライバルとバトル

           ↓

        23番道路

         ↓

     チャンピオンロード

        ↓

セキエイ高原  ・ポケモンリーグの四天王とバトル

          ・ライバルとのラストバトル

               ↓

           エンディング